MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces scabiei 87.22 chromosome

Total Repeats: 291116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013929	TGC	2	6	50	55	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013929	TCCGC	2	10	72	81	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_013929	GCA	2	6	111	116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013929	TGC	2	6	124	129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013929	GCG	2	6	254	259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013929	CGGCG	2	10	262	271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013929	CG	3	6	270	275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013929	CGGGC	2	10	433	442	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013929	AGGG	2	8	451	458	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013929	TCGT	2	8	465	472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013929	GC	4	8	489	496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013929	GCA	2	6	508	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013929	C	6	6	540	545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_013929	ACC	2	6	547	552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013929	CGGG	2	8	553	560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013929	GGAC	2	8	648	655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013929	GC	3	6	688	693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013929	GGT	2	6	718	723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013929	GCGG	2	8	738	745	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013929	GAG	2	6	752	757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013929	GTG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013929	GGT	2	6	835	840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013929	GAG	2	6	842	847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013929	GTCC	2	8	849	856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013929	GCA	2	6	868	873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013929	CGG	2	6	887	892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013929	CAC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013929	CCA	3	9	918	926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013929	CTC	2	6	965	970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013929	GCC	2	6	972	977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013929	GAC	2	6	980	985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013929	TTC	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013929	CGT	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013929	GCG	2	6	1026	1031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013929	CCA	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013929	GCCCTG	2	12	1099	1110	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013929	TCC	2	6	1112	1117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013929	ACC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013929	CTG	2	6	1183	1188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013929	GGCC	2	8	1201	1208	0 %	0 %	50 %	50 %	290954632
41	NC_013929	CGG	2	6	1241	1246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954632
42	NC_013929	TCG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954632
43	NC_013929	AGC	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954632
44	NC_013929	AGG	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954632
45	NC_013929	CGGAGC	2	12	1376	1387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	290954632
46	NC_013929	CGG	2	6	1464	1469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954632
47	NC_013929	GCT	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954632
48	NC_013929	GAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954632
49	NC_013929	CT	3	6	1544	1549	0 %	50 %	0 %	50 %	290954632
50	NC_013929	AGG	2	6	1580	1585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954632
51	NC_013929	GAG	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954632
52	NC_013929	GACG	2	8	1639	1646	25 %	0 %	50 %	25 %	290954632
53	NC_013929	ATC	2	6	1724	1729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290954633
54	NC_013929	CAC	3	9	1967	1975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
55	NC_013929	CT	3	6	2039	2044	0 %	50 %	0 %	50 %	290954633
56	NC_013929	CGA	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
57	NC_013929	CGGG	2	8	2116	2123	0 %	0 %	75 %	25 %	290954633
58	NC_013929	CAG	2	6	2139	2144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
59	NC_013929	CAT	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290954633
60	NC_013929	CGA	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
61	NC_013929	GGC	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
62	NC_013929	ACA	2	6	2227	2232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290954633
63	NC_013929	CGC	2	6	2240	2245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
64	NC_013929	CGC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
65	NC_013929	CCCG	2	8	2293	2300	0 %	0 %	25 %	75 %	290954633
66	NC_013929	AGCGC	2	10	2483	2492	20 %	0 %	40 %	40 %	290954633
67	NC_013929	CCA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
68	NC_013929	GGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954633
69	NC_013929	ACG	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
70	NC_013929	CGA	3	9	2651	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
71	NC_013929	GGC	2	6	2663	2668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
72	NC_013929	AGCC	2	8	2720	2727	25 %	0 %	25 %	50 %	290954633
73	NC_013929	GCG	2	6	2767	2772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
74	NC_013929	ACC	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
75	NC_013929	CCA	2	6	2830	2835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
76	NC_013929	CCA	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
77	NC_013929	ATC	2	6	3021	3026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290954633
78	NC_013929	TCC	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290954633
79	NC_013929	ATG	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954633
80	NC_013929	TCG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954633
81	NC_013929	AGC	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
82	NC_013929	TCG	2	6	3214	3219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954633
83	NC_013929	CGG	2	6	3224	3229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
84	NC_013929	CG	3	6	3307	3312	0 %	0 %	50 %	50 %	290954633
85	NC_013929	CGC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
86	NC_013929	CGC	2	6	3326	3331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
87	NC_013929	CCA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
88	NC_013929	GGA	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954633
89	NC_013929	GCG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
90	NC_013929	CTG	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954633
91	NC_013929	CGC	2	6	3620	3625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
92	NC_013929	C	6	6	3661	3666	0 %	0 %	0 %	100 %	290954633
93	NC_013929	GCA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
94	NC_013929	CGG	2	6	3738	3743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
95	NC_013929	GGC	2	6	3747	3752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
96	NC_013929	GCGG	2	8	3770	3777	0 %	0 %	75 %	25 %	290954633
97	NC_013929	GC	3	6	3782	3787	0 %	0 %	50 %	50 %	290954633
98	NC_013929	GCG	2	6	3798	3803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
99	NC_013929	CGA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
100	NC_013929	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
101	NC_013929	CGA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
102	NC_013929	CAG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
103	NC_013929	CG	3	6	4162	4167	0 %	0 %	50 %	50 %	290954633
104	NC_013929	GTC	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013929	GTG	2	6	4378	4383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954634
106	NC_013929	GTT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290954634
107	NC_013929	GGCG	2	8	4450	4457	0 %	0 %	75 %	25 %	290954634
108	NC_013929	CTG	2	6	4478	4483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
109	NC_013929	TGC	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
110	NC_013929	GTG	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954634
111	NC_013929	GAG	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954634
112	NC_013929	TTCC	2	8	4673	4680	0 %	50 %	0 %	50 %	290954634
113	NC_013929	GCT	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
114	NC_013929	CTG	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
115	NC_013929	GCC	2	6	4854	4859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954634
116	NC_013929	GGC	2	6	4900	4905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013929	CGT	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
118	NC_013929	TGC	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
119	NC_013929	AGT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954635
120	NC_013929	TCG	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
121	NC_013929	GGC	2	6	5074	5079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
122	NC_013929	CGG	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
123	NC_013929	CGT	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
124	NC_013929	AGG	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954635
125	NC_013929	CCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954635
126	NC_013929	ACG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
127	NC_013929	CCG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954635
128	NC_013929	CGG	2	6	5316	5321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
129	NC_013929	TGC	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
130	NC_013929	CCAGGG	2	12	5343	5354	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	290954635
131	NC_013929	GTG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
132	NC_013929	GAG	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954635
133	NC_013929	TGGG	2	8	5407	5414	0 %	25 %	75 %	0 %	290954635
134	NC_013929	GCG	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
135	NC_013929	GC	3	6	5549	5554	0 %	0 %	50 %	50 %	290954635
136	NC_013929	TGG	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
137	NC_013929	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
138	NC_013929	GCC	2	6	5602	5607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954635
139	NC_013929	GCCG	2	8	5670	5677	0 %	0 %	50 %	50 %	290954635
140	NC_013929	CGG	2	6	5780	5785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
141	NC_013929	GGATGC	2	12	5814	5825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290954635
142	NC_013929	TGGTC	2	10	5847	5856	0 %	40 %	40 %	20 %	290954635
143	NC_013929	CGA	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
144	NC_013929	GCG	2	6	5926	5931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
145	NC_013929	CGA	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
146	NC_013929	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
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150	NC_013929	CGG	2	6	6138	6143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
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152	NC_013929	CGTC	2	8	6218	6225	0 %	25 %	25 %	50 %	290954635
153	NC_013929	GGCG	2	8	6258	6265	0 %	0 %	75 %	25 %	290954635
154	NC_013929	CGA	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
155	NC_013929	GGA	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954635
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159	NC_013929	GTA	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954635
160	NC_013929	CGCAG	2	10	6585	6594	20 %	0 %	40 %	40 %	290954635
161	NC_013929	TGA	2	6	6600	6605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954635
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164	NC_013929	TGC	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
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168	NC_013929	TCT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290954635
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171	NC_013929	TCTGG	2	10	7138	7147	0 %	40 %	40 %	20 %	290954635
172	NC_013929	TGC	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
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176	NC_013929	CCCG	2	8	7277	7284	0 %	0 %	25 %	75 %	290954635
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178	NC_013929	GTG	2	6	7490	7495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
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187	NC_013929	GTG	2	6	7852	7857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954636
188	NC_013929	ATC	2	6	7879	7884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290954636
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206	NC_013929	GCCC	2	8	8562	8569	0 %	0 %	25 %	75 %	290954636
207	NC_013929	TCCGCC	2	12	8590	8601	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	290954636
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209	NC_013929	ACC	2	6	8694	8699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
210	NC_013929	GCC	2	6	8708	8713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
211	NC_013929	GCC	2	6	8729	8734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
212	NC_013929	GGC	2	6	8740	8745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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214	NC_013929	CACT	2	8	8945	8952	25 %	25 %	0 %	50 %	290954637
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230	NC_013929	GGC	2	6	9445	9450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954637
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239	NC_013929	GCTTC	2	10	9842	9851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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250	NC_013929	GGAC	2	8	10263	10270	25 %	0 %	50 %	25 %	290954638
251	NC_013929	CGC	2	6	10290	10295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954638
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254	NC_013929	TGG	2	6	10322	10327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954638
255	NC_013929	GAAGGT	2	12	10345	10356	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	290954638
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259	NC_013929	AGC	2	6	10449	10454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954638
260	NC_013929	TGC	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954638
261	NC_013929	TGG	3	9	10485	10493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954638
262	NC_013929	ACG	2	6	10514	10519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954638
263	NC_013929	GGGT	2	8	10529	10536	0 %	25 %	75 %	0 %	290954638
264	NC_013929	GTG	3	9	10550	10558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954638
265	NC_013929	CGG	2	6	10581	10586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954638
266	NC_013929	GGCGG	2	10	10606	10615	0 %	0 %	80 %	20 %	290954638
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268	NC_013929	GCGG	2	8	10663	10670	0 %	0 %	75 %	25 %	290954638
269	NC_013929	GCGG	2	8	10684	10691	0 %	0 %	75 %	25 %	290954638
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392	NC_013929	CGC	2	6	14884	14889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
393	NC_013929	TGG	2	6	14901	14906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_013929	CGT	2	6	14994	14999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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